当前水土保持生态建设中还有若干问题需要探讨和研究：一是水资源问题。水土保持措施可以控制面源污染保护水资源，同时会改变水资源的时空分布。在水土保持生态建设中必须研究生态用水的问题。二是生态自我修复的理论与实践问题。生态自我修复理论的基础是生态环境发展演变的自然规律，开展生态自我修复的实践基础是水土流失防治的现实需要。三是前期工作问题。水土保持工程建设前期工作应避免生搬硬套水利工程前期工作阶段划分，或者流于形式、走过场两种倾向。四是群众参与水土保持工程建设问题。根据中央农村税费改革精神，做好群众投工方式的调整，建立群众参与水土保持工程建设的机制。